| CRISPR/Cas9系统广泛应用于多种细胞系基因敲除株的构建
其中最大的需求就是细胞系基因敲除,如何快速高效构建自己的敲除细胞株是很多人关心的问题。但是,实验时我们往往发现,很难获得细胞敲除纯合克隆,预期的基因敲除经常伴随着很多问题,导致克隆的阳性率往往徘徊在1%以下。
Cas9X | 海星生物带你一起了解一下具体的技术流程:
| 第一、细胞系基因敲除的细胞选择
1. 细胞先考虑肿瘤细胞,或者是有文献报道的细胞系;成功有保证!
2. 细胞系的培养基便宜,血清要求不高的优先考虑;
3. 细胞能够形成克隆,细胞增殖快速的细胞系优先考虑;
4. 细胞染色体稳定,细胞不易分化的优先考虑;
5. 慎重选择悬浮细胞效率比较低;
| 第二、细胞系敲除的基因要慎重选择
1. 原癌基因敲除后,细胞增殖会有问题,所以要考虑基因敲除对细胞株增殖的影响;
2. 抑癌基因敲除没有任何影响;
3. 细胞信号通路的有时候会导向细胞增殖停止,所以要考虑做单克隆敲除;
4. 细胞基因敲除一般选择片段敲除,慎重考虑移码,会影响后续的cDNA基因回补实验;
| 第三、细胞系基因敲除之后的鉴定分析流程
1. 做PCR检测目的基因,看看有没有完全敲除;
2. PCR产物要做测序,看看序列的实际情况;
3. mRNA检测,看看是否有敲除效果;
4. WB检测,看看蛋白的情况如何;
5. 生物学表型检测;
最后就是做拯救实验,就是将敲除的基因回补到细胞基因组!就完成了一个完整的细胞系敲除研究的所有步骤了。